Наиболее вероятная причина в контроллерах, которые прописаны в партии(-ях), особливо если этот миди файл скачан откуда-нить. Некоторые Вокстэйшны прописывают состояние контроллеров таких как громкость, прогр. чейнж, панорама, эффекты и т.д. с момента начала записи, и не важно начало это песни или середина, просто- запись нажал контры прописались. При воспроизведении они каждый раз долбят генератор звуков. Их нужно просто удалить из миди партитуры. В кубасе это просто: обозначить трэк или партию, правая кнопка мышы, лист эдитор, а дальше убить всё что не относится к нотам, ну кроме полезных контроллеров, таких как питч, модуляция и т.д.